Tanggal 26-27 Mei 2007 di Wisma Putra Jaya, Kaliurang diadakan Musyawarah Wilayah JMKI wilayah Yogyakarta atau Muswil JMKI wilayah Yogyakarta. Muswil kali ini dihadiri oleh :
- PSIK FK UGM
- FK UGM
- FKG UGM
- FARMASI UGM
- FARMASI USD
- FARMASI UAD
- PSIK STIKES AISYIAH
Muswil ini menghasilkan beberapa keputusan yaitu :
- Peraturan Wilayah JMKI wilayah Yogyakarta
- Garis besar haluan kerja (GBHK) JMKI wilayah Yogyakarta
- Memilih koordinator wilayah JMKI wilayah Yogyakarta
- Menerima LPJ PHW wilayah JMKI wilayah Yogyakarta periode 2006-2007